Nouvelle publication du plateau Bio-informatique du CRCT dans NAR

Frédéric Pont, Marie Tosolini et Marion Perrier, du plateau de Bio-Informatique,  en collaboration avec Jean-Jacques Fournié (Directeur de recherche, équipe 9 du CRCT) viennent de publier un nouvel article dans NAR Genomics and Bioinformatics (Volume 2, Issue 2, June 2020):

« Single-Cell Virtual Cytometer allows user-friendly and versatile analysis and visualization of multimodal single cell RNAseq datasets »

Vous pouvez découvrir l’article ici.

Single-Cell Virtual Cytometer est un logiciel open source permettant la visualisation et l’exploration des données (anticorps, expression de gènes, signatures…) de single cell RNAseq comme en cytométrie en flux. Le logiciel et son manuel son disponibles ici :

https://github.com/FredPont/single-cell-virtual-cytometer

Des vidéos de démonstration sont disponibles en supplemental data sur le site de la publication.

Ce logiciel s’utilise dans un navigateur web sans installation. Il est compatible avec

Single-Cell Signature Explorer

https://sites.google.com/site/fredsoftwares/products/single-cell-signature-explorer