Les travaux du Plateau Bioinformatique en couverture de NAR

Les travaux de Frédéric Pont, Marie Tosolini  (plateau de bioinformatique) et Jean-Jacques Fournié (équipe 9, CRCT) illustrent la couverture du  volume n°47 (issue 21) de NAR (Nucleic Acids Research). Frédéric, Marie et Jean-Jacques ont conçu une série de programmes pour faciliter l’exploration des données Single-Cell RNAseq. Ils permettent de calculer les scores d’enrichissement de fonctions biologiques (plus de 20 000 fonctions biologiques humaines sont disponibles) au niveau de la cellule unique et ensuite les visualiser sur des milliers de cellules sur des cartes en deux dimensions.

Lien avec l’article: https://doi.org/10.1093/nar/gkz601

Ouverture à l’expertise de l’irradiateur XRad Smart plus pour cellules et petit animal (Jack)

Le Pôle Technologique est heureux de vous annoncer l’ouverture de l’utilisation de l’irradiateur XRad Smart plus de PXI. Son achat a été possible grâce à un financement conjoint de l’institut Claudius Regaud et INSERM plan Cancer.

Il est localisé dans la zone ENI du CREFRE au rez-de-chaussée du bâtiment Inserm-Oncopole, et est sous la responsabilité technique de Caroline Delmas (Delmas.Caroline@iuct-oncopole.fr).

Vous trouverez toutes les informations techniques sur notre site web, dans l’onglet Expertise/Imagerie.

Séminaire Meso Scale Dicovery, 12 février 2019, 11h, CRCT.

La société MSD viendra présenter une nouvelle technologie permettant la quantification  de biomarqueurs dans un échantillon de 25 µL, en format simple ou multiplex, (dosage de plusieurs biomarqueurs dans un seul puits). La détection du signal est réalisée par électrochemiluminescence, ce qui permet une gamme de détection très dynamique et très sensible (1 pg/mL). Plusieurs kits sont disponibles pour explorer l’immunologie, l’inflammation, l’oncologie, les phosphoprotéines, la signalisation,…

Pour en savoir plus: https://www.mesoscale.com/en/products_and_services/instrumentation.

>>Télécharger l’affiche du séminaire

Journée Single Cell RNAseq (technologie 10X Genomics), Toulouse, 15 Janvier 2019

Le Pôle Technologique du CRCT, est partenaire avec GeT-Santé et la société 10x Genomics, dans l’organisation d’une journée autour des approches Single Cell (technologie 10X Genomics), le mardi 15 Janvier 2019, de 10h30 à 16h, salle Hervé Paris à l’I2MC (Rangueil, Toulouse). Cette journée sera consacrée aux retours d’expérience d’utilisateurs et aux nouveautés 10x Genomics (ATAC-Seq, CITE-Seq….).

Programme et Inscription gratuite mais obligatoire jusqu’au 8 décembre 2018

ici (https://www.eventbrite.com/e/10x-genomics-seminar-toulouse-registration-52477425392)

 

 

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