Workshop « Mise en lumière de vos échantillons 3D »: 15 avril et 7-11 juin 2021

Le Plateau d’Imagerie Cellulaire du Pôle Technologique du CRCT vous invite au workshop « Mise en lumière de vos échantillons 3D ».

15 avril 2021: Phase préparatoire

  • Matin : Présentation générale de nos partenaires et des technologies qui seront mises à disposition lors des ateliers en juin (Ouvert à tous)
  • Après-Midi : Speed dating pour préparer au mieux les expériences que vous voulez réaliser, analyser, et que vous « imagerez » en juin (cette étape est cruciale pour la réussite de vos expériences)

7-11 juin 2021: Workshop

  • Matins : Séminaires spécifiques de nos partenaires (ouverts à tous)
  •  Après-Midi : ateliers (inscription obligatoire) avec vos propres échantillons ou ceux mis à disposition par nos partenaires

Vous pourrez rencontrer de nombreux partenaires privés et publics pour vous permettre de préparer, imager, analyser et visualiser vos échantillons 3D. Vous pourrez imager vos propres échantillons en imagerie 3D et les visualiser en réalité virtuelle.

En savoir+

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Nouvelle publication du plateau Bio-informatique du CRCT dans NAR

Frédéric Pont, Marie Tosolini et Marion Perrier, du plateau de Bio-Informatique,  en collaboration avec Jean-Jacques Fournié (Directeur de recherche, équipe 9 du CRCT) viennent de publier un nouvel article dans NAR Genomics and Bioinformatics (Volume 2, Issue 2, June 2020):

« Single-Cell Virtual Cytometer allows user-friendly and versatile analysis and visualization of multimodal single cell RNAseq datasets »

Vous pouvez découvrir l’article ici.

Single-Cell Virtual Cytometer est un logiciel open source permettant la visualisation et l’exploration des données (anticorps, expression de gènes, signatures…) de single cell RNAseq comme en cytométrie en flux. Le logiciel et son manuel son disponibles ici :

https://github.com/FredPont/single-cell-virtual-cytometer

Des vidéos de démonstration sont disponibles en supplemental data sur le site de la publication.

Ce logiciel s’utilise dans un navigateur web sans installation. Il est compatible avec

Single-Cell Signature Explorer

https://sites.google.com/site/fredsoftwares/products/single-cell-signature-explorer

Séminaire en ligne : Préparation du Worshop « Highlight your 3D samples » -Jeudi 16 avril 2020, 10h

Le Pôle Technologique vous invite à un séminaire « Highlight your 3D samples »de présentation en ligne et de préparation au workshop le jeudi 16 avril, de 10h à 12h.

Au programme :

Matin
Séminaires technologiques

Impression 3D et préparation des échantillons (CELLINK)

Imager en 3D  (ZEISS et Miltenyii)

Analyser en 3D (IMACTIV-3D et Perkin Elmer)

Visualiser en 3D (IRIT)

Après-midi
Rencontres en ligne avec les intervenants
Echangez avec les industriels sous forme de speed-dating en ligne !

Lien rejoindre la réunion Teams :

Lien Workshop Imagerie 3D


Image de l’annonce issue de Miltenyi Biotech

Mardi 10 Mars 2020 : Journée Single Cell et Spatial Gene Expression.

Le Pôle Technologique du CRCT, la plateforme GeT, et la société 10x Genomics ont le plaisir de vous convier à une journée autour des approches Single Cell, des nouvelles applications et des nouveaux outils disponibles dont la Spatial Gene Expression.

Pendant cette journée, vous seront présentées différentes approches méthodologiques et analytiques à travers le retour d’expériences de plusieurs utilisateurs.

Cette journée se tiendra le Mardi 10 Mars 2020 de 9h à 16h30, salle H. Paris, I2MC, bâtiment L4, Rangueil, Toulouse.

Programme et inscription gratuite mais obligatoire ici

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