Génomique et Transcriptomique

La plateforme de génomique-transcriptomique du CRCT est en cours de développement. Créée en 2014, elle est dédiée à l’analyse des séquences nucléiques et de leur expression par des techniques de moyen débit. La plateforme dispose actuellement d’appareils de PCR quantitative et d’équipements de fractionnement de polysomes pour l’analyse du traductome. Récemment, la plateforme s’est équipée d’un scanner de puces de haute performance (Ilumina Iscan) permettant des analyses dans des domaines divers tels que méthylation, expression, génotypage, cytogénomique…

Les appareils disponibles sur la plateforme sont les suivants :

  • qPCR : Deux StepOne Plus (Applied Biosystems, Life Technologies)
  • qPCR : Un Abi7500 (Applied, Life Technologies)
  • polysome profiling : un collecteur de fraction pour gradient de densité (ISCO)
  • Un scanner de puces iScan (Illumina)

La réservation des appareils de qPCR s’effectue en ligne via le site OBM (https://OBM.inserm.fr)

La plateforme vous permet également d’accéder au nCounter de Nanostring technologies situé sur l’IUC-TO pour la quantification moyen débit de cibles multiplexées ADN, ARN ou protéines par détection directe, sans amplification.

La plateforme devrait s’ouvrir prochainement aux technologies de séquençage NGS.

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