Fragment Analyzer

Contrôle Qualité des ARN, ADNg, librairies NGS et fragments de PCR

Le plateau possède un système d’électrophorèse automatisé de 12 capillaires, le Fragment Analyzer d’Agilent formerly Advanced Analytical (www.aati-us.com). Cet instrument permet de vérifier la qualité des ARN (niveau d’intégrité et de dégradation des ARN), des ADNg et des librairies NGS. Il délivre un profil de migration, une image simulée de gel, la concentration totale, un indice de qualité (RQN pour l’ARN, GQN pour l’ADN) et le rapport 18S/28S pour les ARN. Le dosage se fait par 11-12 échantillons /run avec 2µl.

Cet appareil est également disponible pour les utilisateurs en autonomie après formation, pour la visualisation et la détermination de la taille de fragments de PCR notamment pour le génotypage de lignées murines. Cela remplace le gel d’agarose. L’avantage de cet appareil est de gérer de nombreux échantillons, jusqu’à 3 plaques 96 puits soit 288 échantillons.